南京市水务建设工程有限公司始建于1967年，原是南京市的国有企业。2018年初，引入非国有资本参与企业公司制改制，改制后的有限公司股东为A：南京市长江河道管理处；B：正太集团有限公司。其中A持改制后公司49%的股权，B持改制后公司51%的股权，改制后公司名称变更为南京市水务建设工程有限公司，改制后的公司除正常经营之外，还承担了长江的防洪抢险等应急工作。

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